เนื่องจากกระทรวงสาธารณสุขได้ออกกฎกระทรวง ยกเว้นค่าธรรมเนียมใบอนุญาต และหนังสือรับรองการแจ้ง ตามกฎกระทรวงกำหนดค่าธรรมเนียมในการออกใบอนุญาต หนังสือรับรองการแจ้ง และการให้บริการในการจัดการสิ่งปฏิกูลหรือมูลฝอย พ.ศ. 2559 ทำให้งานสุขาภิบาลและอนามัยสิ่งแวดล้อม ฝ่ายบริหารงานสาธารณสุข กองสาธารณสุขและสิ่งแวดล้อม ไม่สามารถเก็บค่าธรรมเนียมใบอนุญาต และหนังสือรับรองการแจ้ง ทั้งนี้กิจการที่ได้รับการยกเว้นค่าธรรมเนียมตามกฎกระทรวงสาธารณสุข ได้แก่
1. ใบอนุญาตดำเนินกิจการที่เป็นอันตรายต่อสุขภาพ ตามประเภทที่มีข้อบัญญัติท้องถิ่นกำหนดให้เป็นกิจการที่ต้องมีการควบคุมภายในท้องถิ่น ตามมาตรา 32(1) ในลักษณะที่เป็นการค้า
2. ใบอนุญาตจัดตั้งตลาดตามมาตรา 34
3. ใบอนุญาตจัดตั้งสถานที่จำหน่ายอาหารหรือสถานที่สะสมอาหารที่มีพื้นที่เกินสองร้อยตารางเมตรและมิใช่เป็นการขายของในตลาดตามมาตรา 38
4. ใบอนุญาตจำหน่ายสินค้าในที่หรือทางสาธารณะตามมาตรา 41 วรรค 2
5. หนังสือรับรองการแจ้งจัดตั้งสถานที่จำหน่ายอาหารหรือสถานที่สะสมอาหารที่มีพื้นที่ไม่เกินสองร้อยตารางเมตร และมิใช่เป็นการขายของในตลาดตามมาตรา 38
